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拉梅尔芽孢杆菌属泛基因组的分析方法【异议或纠错】

档案编号: CQ-114-3723-3801
档案文号:
专利权人: 申请人 
发布时间: 发布时间 
档案分类: 专利权 
分 类 号: 第G16B50/00;G16B45/00;G16B40/00;G16B50/10;G16B30/00类
授权状态: 已授权
档案内容: 本发明属于生物信息技术领域,具体涉及拉梅尔芽孢杆菌属泛基因组的分析方法。目前拉梅尔芽孢杆菌泛基因组还未见分析和报道,本发明提供拉梅尔芽孢杆菌属泛基因组的分析方法,包括以下步骤:获取拉梅尔芽孢杆菌的蛋白质编码序列,进行泛基因组分析与计算;提取待分析的共有保守蛋白的基因序列,选取最大似然法构建系统发育树,分析不同菌株之间的遗传进化关系;将待分析的基因组序列两两组合选择,进行ANI值计算,根据ANI值衡量菌株之间相似度,从而验证系统发育树的可靠性。本发明方法具有通用性高、易用性强的优点,整个方法简单,可靠,准确度高,易于理解和使用,操作方便,并且能够提供更全面、更深入的信息。
附件下载:  (原始资料备查)

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