机电工程系是学院重点建设的系部，拥有机电一体化技术、数控技术、数控设备应用与维护、模具设计与制造、电气自动化技术、应用电子技术等六大专业。该系师资力量雄厚，现有专任教师45人，其中双师型教师32人，高级职称教师22人，中级职称教师20人，研究生以上学历达到80%以上。

该系实验、实训、实习条件优越，建有机电一体化设备组装与调试实验室、数控维修实验室、液压传动实验室、CAD/CAM实验室、测量实验室、基础电工实验室、电力拖动实验室、模拟电子实验室、数字电子实验室、机床电气实训室、PLC实验室、自动控制实验室、传感器实验室、单片机实验室等专业实验室；自动化实训中心各种专业设施完备，现有加工中心3台、数控铣床6台、数控车床15台、数控电火花线切割加工机床1台、数控电火花成型加工机床1台、注塑机1台。有江苏常州羊氏模具有限公司、青岛新东洋计电有限公司、北汽福田公司诸城汽车厂、诸城市义和车桥有限公司、诸城市高强度紧固件股份有限公司、诸城市基泰汽修厂、潍柴动力股份有限公司、诸城冠泓数控装备有限公司等二十多个校外实习基地，能充分满足学生教学实习和顶岗实习的需要。与诸城昌达机电科技有限公司合作成立的集研发、生产、实习、培训、售后服务于一体的昌达机电科技研训中心被评为省级高新企业，实现了培训与就业的无缝对接，开创了“设备人才同步制造，产品服务捆绑推销”人才培养新模式。

机电一体化技术专业按照“搭建框架、分流培养”模式组织教学，现设有车工、钳工、焊工、数控操作、设备维修、工艺设计等六个技能训练方向，2011年11月被确定为山东省品牌特色专业。在加强课内教学的同时，该系为学生提供了中高级制图员、中高级车工、钳工、焊工、制造工程师等全国认证的职业技术资格培训，全面提升了学生综合素质，增强了学生在人才市场上的竞争力。在省市举行的大学生创新设计大赛及各项技能比赛中，多次组队参加并取得一、二等奖的优异成绩。专升本成绩优异，平均录取率高达70%，录取学校多为山东理工大学、山东交通学院、青岛科技大学等省内知名院校。学生就业前景广阔，历届毕业生受到用人单位的广泛欢迎，初次专业对口就业率始终保持了95%以上的良好记录。

机电工程系在完成教学任务的同时，还致力于服务当地区域经济的建设与发展。依托2011年10月成立的潍坊工商职业学院机电控制研究所，数控装备研究所广泛开展社会服务，现已与福田雷沃国际重工股份有限公司、天津先瑞科技有限公司、山东恒基农牧机械股份有限公司和西门子公司等多家企业建立了广泛的合作关系，社会反响良好。